專案詳細資料
說明
IQ (2-amino-3-methyl-3H-imidazo[4,5-F]quinoline),為一種常見於食品中的雜環胺類,並被國際癌症組織列為2A級致癌物。目前已有研究證實,IQ對於動物具有致癌性,特別是在肝臟部分尤其顯著,但關於雜環胺類導致癌症的途徑仍尚未研究完畢。本實驗使用iTRAQ (同重位素相對及絕對定量)方法針對以IQ刺激不同時間長度的HepG2 cell樣品進行分析,為了增加鑑定到的蛋白質數目,搭配了不同的三種分餾方法,包含等電聚焦分級分離、鹼性逆相層析法、強陽離子交換層析法,且比較其正交性與互補性。再經由質譜進行分析,結果為三種分餾方法共鑑定到3057個蛋白質及10712個不重複胜肽,並以鹼性逆相層析法所鑑定到的數目最多。且在其中挑選出了391個差異蛋白質,並以Gene Ontology進行分類比較;並在其中又選出較具趨勢性的蛋白質分為上下調進行KEGG pathway分析,主要與ribosome, proteasome, spliceosome, Parkinson’s disease 有較大的相關性,並挑選出其中蛋白質表現下調較明顯的幾個基因(Ribosome- RPS26、RPS4X、RPL37A、RPS24,Parkinson’s disease-SLC25A4、NDUFA8)以qPCR實驗驗證,其中以RPS26、RPL37A趨勢與蛋白質定量結果最為相同。
狀態 | 已完成 |
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有效的開始/結束日期 | 2018/08/01 → 2020/01/31 |
Keywords
- 雜環胺類
- 差異蛋白質體學
- 2-氨基-3-甲基-3H-咪唑並[4
- 5-F]喹啉
指紋
探索此專案觸及的研究主題。這些標籤是根據基礎獎勵/補助款而產生。共同形成了獨特的指紋。