化學物質的表觀基因體雲端分析系統

研究計畫: 政府部門科技部計畫

專案詳細資料

說明

環境中的多種化學物質對於我們的健康與生活產生很大的影響,部分化學物質會藉由參與生物體內的作用機制對疾病發生產生影響,更有一些化學物質會造成食安風險。微核糖核酸(microRNA, miRNA)是一種長度約22個核苷酸,具有高度保守性的單股非編碼RNA(non-coding RNA, ncRNA),其在生物體中扮演相當多樣且重要的基因調控角色。目前有超過2500種成熟的miRNA在人體內被發現並記錄,並且有多種預測miRNA目標基因的演算法,然而卻缺乏miRNA、環境化合物與人體健康關聯性的資料庫或演算法。為了發展一套關於化學物質與表觀遺傳間關聯性的可信預測方法,此應用平臺會比較化學物質影響的基因與miRNA目標基因,並通過生物途徑,找出化學物質、miRNA與人體健康之間可能的關聯。藉由文獻探討,我們獲得關於miRNA、化學物質對人體基因的影響,並藉由miRNA目標基因(Target genes)預測方法找出miRNA與基因間可能的關聯性。這些基因會再進行生物途徑(pathway)分析,找出在人體中可能的影響範圍與作用機制。
狀態已完成
有效的開始/結束日期2017/08/012018/07/31

Keywords

  • 雲端應用
  • 資料庫
  • 化學物質
  • 微核糖核酸
  • 生物途徑
  • 疾病
  • 基因本體論

指紋

探索此專案觸及的研究主題。這些標籤是根據基礎獎勵/補助款而產生。共同形成了獨特的指紋。