Studies of Cap Independent Internal Ribosome Entry Segment Activity of ATXN8OS RNA

蕭 欣杰(Hsin-Chieh Shiau), 陳 怡辰(I-Cheng Chen), 林 玄原(Hsuan-Yuan Lin), 蘇 銘燦(Ming-Tsan Su), 李 桂楨(Guey-Jen Lee-Chen)

Research output: Contribution to journalArticle

Abstract

第八型脊髓小腦運動失調症與ATXN8OS CUG重複擴增RNA及ATXN8多麩醯胺擴增的蛋白相關。雖然在CTG方向被轉錄、選擇性裁接及加上polyA尾,ATXN8OS RNA上僅存在小的開放解讀架構。為探究ATXN8OS RNA上一包含102胺基酸之ORF1及一包含41胺基酸與多白胺酸之ORF2是否被轉譯,我們選殖了人的ATXN8OS cDNA 5’片段,置入水母及螢火蟲雙冷光酶基因間。短暫轉染人類胚胎腎細胞及冷光報告測驗顯示,ATXN8OS RNA上帶有兩個不依賴Cap的內部核醣體進入位置。進一步表現在同一解讀架構上的ORF1-EGFP基因亦證實ORF1的轉譯。結合GFP抗體的西方轉漬分析顯示,上游的non-AUG密碼可能作為ORF1-EGFP蛋白的轉譯起始密碼。ATXN8OS ORF1的生理意義及其在SCA8致病機轉的角色仍有待釐清。
Original languageEnglish
Pages (from-to)1-7
Number of pages7
JournalBio Formosa
Volume47
DOIs
Publication statusPublished - 2012

Fingerprint

Ribosomes
Complementary DNA
RNA

Keywords

  • ATXN8OS
  • 開放解讀架構
  • 內部核醣體進入位置
  • 非AUG轉譯起始密碼
  • ORF
  • IRES
  • non-AUG initiator

Cite this

Studies of Cap Independent Internal Ribosome Entry Segment Activity of ATXN8OS RNA. / 蕭欣杰(Hsin-Chieh Shiau); 陳怡辰(I-Cheng Chen); 林玄原(Hsuan-Yuan Lin); 蘇銘燦(Ming-Tsan Su); 李桂楨(Guey-Jen Lee-Chen).

In: Bio Formosa, Vol. 47, 2012, p. 1-7.

Research output: Contribution to journalArticle

蕭欣杰(Hsin-Chieh Shiau) ; 陳怡辰(I-Cheng Chen) ; 林玄原(Hsuan-Yuan Lin) ; 蘇銘燦(Ming-Tsan Su) ; 李桂楨(Guey-Jen Lee-Chen). / Studies of Cap Independent Internal Ribosome Entry Segment Activity of ATXN8OS RNA. In: Bio Formosa. 2012 ; Vol. 47. pp. 1-7.
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publisher = "臺灣師範大學生命科學系",

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TY - JOUR

T1 - Studies of Cap Independent Internal Ribosome Entry Segment Activity of ATXN8OS RNA

AU - 蕭, 欣杰(Hsin-Chieh Shiau)

AU - 陳, 怡辰(I-Cheng Chen)

AU - 林, 玄原(Hsuan-Yuan Lin)

AU - 蘇, 銘燦(Ming-Tsan Su)

AU - 李, 桂楨(Guey-Jen Lee-Chen)

PY - 2012

Y1 - 2012

N2 - 第八型脊髓小腦運動失調症與ATXN8OS CUG重複擴增RNA及ATXN8多麩醯胺擴增的蛋白相關。雖然在CTG方向被轉錄、選擇性裁接及加上polyA尾,ATXN8OS RNA上僅存在小的開放解讀架構。為探究ATXN8OS RNA上一包含102胺基酸之ORF1及一包含41胺基酸與多白胺酸之ORF2是否被轉譯,我們選殖了人的ATXN8OS cDNA 5’片段,置入水母及螢火蟲雙冷光酶基因間。短暫轉染人類胚胎腎細胞及冷光報告測驗顯示,ATXN8OS RNA上帶有兩個不依賴Cap的內部核醣體進入位置。進一步表現在同一解讀架構上的ORF1-EGFP基因亦證實ORF1的轉譯。結合GFP抗體的西方轉漬分析顯示,上游的non-AUG密碼可能作為ORF1-EGFP蛋白的轉譯起始密碼。ATXN8OS ORF1的生理意義及其在SCA8致病機轉的角色仍有待釐清。

AB - 第八型脊髓小腦運動失調症與ATXN8OS CUG重複擴增RNA及ATXN8多麩醯胺擴增的蛋白相關。雖然在CTG方向被轉錄、選擇性裁接及加上polyA尾,ATXN8OS RNA上僅存在小的開放解讀架構。為探究ATXN8OS RNA上一包含102胺基酸之ORF1及一包含41胺基酸與多白胺酸之ORF2是否被轉譯,我們選殖了人的ATXN8OS cDNA 5’片段,置入水母及螢火蟲雙冷光酶基因間。短暫轉染人類胚胎腎細胞及冷光報告測驗顯示,ATXN8OS RNA上帶有兩個不依賴Cap的內部核醣體進入位置。進一步表現在同一解讀架構上的ORF1-EGFP基因亦證實ORF1的轉譯。結合GFP抗體的西方轉漬分析顯示,上游的non-AUG密碼可能作為ORF1-EGFP蛋白的轉譯起始密碼。ATXN8OS ORF1的生理意義及其在SCA8致病機轉的角色仍有待釐清。

KW - ATXN8OS

KW - 開放解讀架構

KW - 內部核醣體進入位置

KW - 非AUG轉譯起始密碼

KW - ORF

KW - IRES

KW - non-AUG initiator

U2 - 10.6248/BF.2012.47.01

DO - 10.6248/BF.2012.47.01

M3 - Article

VL - 47

SP - 1

EP - 7

JO - Bio Formosa

JF - Bio Formosa

SN - 1684-0925

ER -