Geographical Variation and Differential Selection Modes of Paralogs of Chloroplast Small Heat Shock Protein Genes in Machilus kusanoi (Lauraceae)

鍾 振德(Jeng-Der Chung), 林 讚標, 鄭 育斌(Yu-Pin Cheng), 黃 士穎(Shih-Ying Hwang)

Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

Abstract

低分子量熱休克蛋白α-水晶體蛋白區域的胺基酸疏水性與多胜肽的鍵結有其重要性並扮演著保護受質蛋白的功能。我們針對大葉楠以族群遺傳的研究角度來瞭解葉綠體低分子量熱休克蛋白基因在地理分布的變異及探討選汰壓力所扮演的角色。由兩個大葉楠低分子量熱休克蛋白同源基因(CPsHSP-1及CPsHSP-2),我們發現CPsHSP-1因同義及非同義置換的突變而有五種單套型的出現;然而CPsHSP-2僅有兩個因同義置換而形成之兩個單套型。CPsHSP-2基因序列的保守性可能與淨化選汰力量有關。相對的,CPsHSP-1在不同族群有不同單套型的組合,其Tajima D的檢測為顯著正值,意味著CPsHSP-1受到均衡選汰力量的影響。大葉楠低分子量熱休克蛋白兩個同源基因CPsHSP-1及CPsHSP-2的疏水性的變異及功能差異的檢測顯示兩者間有功能上的分歧。CPsHSP-1不同單套型之胺基酸疏水性亦呈現變異而可能與其受質蛋白對象的擴充有關。
Original languageEnglish
Pages (from-to)27-36
Number of pages10
JournalBotanical Studies
Volume51
Issue number1
Publication statusPublished - 2010

Keywords

  • 葉綠體低分子量熱休克蛋白
  • 基因複製
  • 疏水性變化
  • 大葉楠
  • 同源基因
  • Chloroplast small heat shock protein
  • Gene duplication
  • Hydrophobicity shift
  • Machilus kusanoi
  • Paralogs

Fingerprint Dive into the research topics of 'Geographical Variation and Differential Selection Modes of Paralogs of Chloroplast Small Heat Shock Protein Genes in Machilus kusanoi (Lauraceae)'. Together they form a unique fingerprint.

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