以RAPD及NBS專一性引子擴增之DNA標誌探討芒果品種間之遺傳相似度

黃 士穎(Shih-Ying Hwang), 張 錦興(Chin-Shing Chang), 林 冠宏(Kuan-Hung Lin)

Research output: Contribution to journalArticle

Abstract

本研究以抗病基因中最主要之核苷酸結合富含白胺酸重複序列(nucleotide binding leucine-rich repeat, NBS-LRR)類型為分析對象,利用15對randomly amplifiedpolymorphic DNA(RAPD)引子與NBS專一引子組合,對32個芒果品種/系之DNA進行polymerase chain reaction(PCR),擴增出含有NBS區域之DNA序列,得到83個抗病基因區域之多型性條帶。經unweighted pair-group method using arithmetic averages(UPGMA)及neighbor joining(NJ)分析,32個品種/系NBS類抗病基因型之遺傳相似度介於0.64-0.84間,可分為5大群,作為芒果NBS類抗病基因型分類的依據。本試驗結果所得之專一性分子標誌可提供芒果栽培品種鑑別之工具。
Original languageChinese
Pages (from-to)285-294
Number of pages10
Journal臺灣園藝
Volume58
Issue number4
DOIs
Publication statusPublished - 2012

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以RAPD及NBS專一性引子擴增之DNA標誌探討芒果品種間之遺傳相似度. / 黃士穎(Shih-Ying Hwang); 張錦興(Chin-Shing Chang); 林冠宏(Kuan-Hung Lin).

In: 臺灣園藝, Vol. 58, No. 4, 2012, p. 285-294.

Research output: Contribution to journalArticle

黃士穎(Shih-Ying Hwang) ; 張錦興(Chin-Shing Chang) ; 林冠宏(Kuan-Hung Lin). / 以RAPD及NBS專一性引子擴增之DNA標誌探討芒果品種間之遺傳相似度. In: 臺灣園藝. 2012 ; Vol. 58, No. 4. pp. 285-294.
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abstract = "本研究以抗病基因中最主要之核苷酸結合富含白胺酸重複序列(nucleotide binding leucine-rich repeat, NBS-LRR)類型為分析對象,利用15對randomly amplifiedpolymorphic DNA(RAPD)引子與NBS專一引子組合,對32個芒果品種/系之DNA進行polymerase chain reaction(PCR),擴增出含有NBS區域之DNA序列,得到83個抗病基因區域之多型性條帶。經unweighted pair-group method using arithmetic averages(UPGMA)及neighbor joining(NJ)分析,32個品種/系NBS類抗病基因型之遺傳相似度介於0.64-0.84間,可分為5大群,作為芒果NBS類抗病基因型分類的依據。本試驗結果所得之專一性分子標誌可提供芒果栽培品種鑑別之工具。",
keywords = "漆樹科, 核苷酸結合富含白胺酸重複序列, 分子標誌, 親緣關係圖, 品種鑑定, Anacardiaceae, nucleotide binding leucine-rich repeat (NBS-LRR), DNA marker, phylogenetic tree, variety identification",
author = "黃, {士穎(Shih-Ying Hwang)} and 張, {錦興(Chin-Shing Chang)} and 林, {冠宏(Kuan-Hung Lin)}",
year = "2012",
doi = "10.6964/JTSHS.201212.0285",
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publisher = "臺灣園藝學會",
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TY - JOUR

T1 - 以RAPD及NBS專一性引子擴增之DNA標誌探討芒果品種間之遺傳相似度

AU - 黃, 士穎(Shih-Ying Hwang)

AU - 張, 錦興(Chin-Shing Chang)

AU - 林, 冠宏(Kuan-Hung Lin)

PY - 2012

Y1 - 2012

N2 - 本研究以抗病基因中最主要之核苷酸結合富含白胺酸重複序列(nucleotide binding leucine-rich repeat, NBS-LRR)類型為分析對象,利用15對randomly amplifiedpolymorphic DNA(RAPD)引子與NBS專一引子組合,對32個芒果品種/系之DNA進行polymerase chain reaction(PCR),擴增出含有NBS區域之DNA序列,得到83個抗病基因區域之多型性條帶。經unweighted pair-group method using arithmetic averages(UPGMA)及neighbor joining(NJ)分析,32個品種/系NBS類抗病基因型之遺傳相似度介於0.64-0.84間,可分為5大群,作為芒果NBS類抗病基因型分類的依據。本試驗結果所得之專一性分子標誌可提供芒果栽培品種鑑別之工具。

AB - 本研究以抗病基因中最主要之核苷酸結合富含白胺酸重複序列(nucleotide binding leucine-rich repeat, NBS-LRR)類型為分析對象,利用15對randomly amplifiedpolymorphic DNA(RAPD)引子與NBS專一引子組合,對32個芒果品種/系之DNA進行polymerase chain reaction(PCR),擴增出含有NBS區域之DNA序列,得到83個抗病基因區域之多型性條帶。經unweighted pair-group method using arithmetic averages(UPGMA)及neighbor joining(NJ)分析,32個品種/系NBS類抗病基因型之遺傳相似度介於0.64-0.84間,可分為5大群,作為芒果NBS類抗病基因型分類的依據。本試驗結果所得之專一性分子標誌可提供芒果栽培品種鑑別之工具。

KW - 漆樹科

KW - 核苷酸結合富含白胺酸重複序列

KW - 分子標誌

KW - 親緣關係圖

KW - 品種鑑定

KW - Anacardiaceae

KW - nucleotide binding leucine-rich repeat (NBS-LRR)

KW - DNA marker

KW - phylogenetic tree

KW - variety identification

U2 - 10.6964/JTSHS.201212.0285

DO - 10.6964/JTSHS.201212.0285

M3 - 文章

VL - 58

SP - 285

EP - 294

JO - 臺灣園藝

JF - 臺灣園藝

SN - 1819-8317

IS - 4

ER -